Die Positiven Erfahrungen aus der "ökologischen Stadterneuerung Gostenhof Ost" führten dazu, dass die Stadt Nürnberg, das Evangelische Siedlungswerk, Brochier Haustechnik, AEG, Obi Baumarkt Franken und die wbg-Nürnberg, 1996 die Stiftung Stadtökologie Nürnberg gründeten.

Die Stiftung Stadtökologie führte  2000-2002 das vom Bayerischen Wirtschaftsministerium geförderte Modellprojekt “Energieeinspar-Anstoßberatung“ durch und erstellte 2003 das bundesweit anerkannte Handbuch „Vom Altbau zum Passivhaus“ mit einer Vielzahl von positiven Beispielen und Fotos aus dem Wohnungsbau in Mittelfranken.

2004-2005 beteiligte sich die Stiftung am Projekt „Energie-Achse Südstadt“, einem Energiekonzept mit Prozesscharakter, mit Gestaltungslösungen und integrativer Bürgerbeteiligung in der Nürnberger Südstadt.

2006 erarbeitete die Stiftung einen Leitfaden "Energiemanagement im Geschosswohnungsbestand“ für Wohnungsunternehmen, Hausverwaltungen und Hauseigentümer.

Seit Anfang 2007 ist die Stiftung Stadtökologie Nürnberg Kooperationspartner des ENERGIEregion Nürnberg e. V . und übernimmt damit Aufgaben aus dem Geschäftsfeld "Bau und Energie". Schwerpunkt ist dabei insbesondere die Energieeffizienz im Geschosswohnungsbau.